중도퇴사자 연말정산은 퇴직하는 달 급여를 받을 때 회사가 해 주고, 못 받았다면 다음 해 5월 1일부터 5월 31일 사이 종합소득세로 직접 정산해요. 환급은 이미 낸 세금이 계산된 세액보다 클 때 생겨요.
연말 전에 퇴사했다면 회사는 퇴직하는 달 근로소득을 지급할 때 연말정산을 해요. 그때 정산을 못 받았다면 다음 해 5월 1일부터 5월 31일에 종합소득세로 직접 신고해요. 이미 낸 세금이 계산된 세액보다 크면 초과액이 환급돼요.
📌 핵심콕콕
한눈에 보는 중도퇴사자 연말정산
퇴사하는 달 급여를 받는다면 회사가 그 달에 연말정산을 해요. 퇴직하는 날까지의 소득만 계산하고, 낸 세금이 많으면 환급이 정리돼요.
그해 퇴직하는 날까지의 기간만 계산해요
공제를 신고하지 않으면 본인 기본공제와 표준세액공제만 적용해요
여기서 이미 낸 세금과 세액공제를 빼요
낸 세금이 더 많으면 환급, 모자라면 추가 납부예요
퇴직자는 연말을 기다리지 않고 퇴직하는 달 근로소득을 지급할 때 정산해요. 퇴직하는 날까지의 근로소득금액에 신고한 공제를 적용해 세액을 구하고, 그해 이미 원천징수한 세액과 세액공제를 뺀 차액을 보는 순서예요. 이미 낸 세금이 더 많으면 초과액을 돌려받고, 모자라면 추가로 내요. 부양가족 같은 공제를 반영하려면 퇴사 전에 회사에 공제 신고를 내야 해요.
이미 낸 세금이 어떻게 잡히는지는 연말정산 기납부세액 글에서 이어서 볼 수 있어요. 연말정산 기납부세액 →
소득세법 제137조 제1항 원천징수의무자는 해당 과세기간의 다음 연도 2월분의 근로소득 또는 퇴직자의 퇴직하는 달의 근로소득을 지급할 때에는 다음 각 호의 순서에 따라 계산한 소득세(이하 이 조에서 “추가 납부세액”이라 한다)를 원천징수한다.
회사가 본인 기본공제와 표준세액공제만 적용해 정산해요. 부양가족 같은 공제는 빠진 채 정산되니 5월 종합소득세 신고에서 따로 따져요.
퇴직 정산은 퇴사자가 공제 내용을 미리 신고했다는 전제로 계산해요. 신고가 없으면 기본공제 중 본인분과 표준세액공제만 적용하고 추가 납부세액을 원천징수해요. 이 경우 5월 종합소득세 신고에서는 인적공제 등 대상임을 증명하는 서류를 신고서에 붙여 내요.
소득세법 제137조 제3항 원천징수의무자가 제140조에 따른 신고를 하지 아니한 근로소득자에 대하여 제1항을 적용하여 추가 납부세액을 원천징수할 때에는 기본공제 중 그 근로소득자 본인에 대한 분과 표준세액공제만을 적용한다.
연말정산을 못 받고 퇴사했다면 다음 해 5월 1일부터 5월 31일에 근로소득을 종합소득세로 직접 신고해요. 낸 세금이 더 많으면 환급이 나와요.
9월에 회사를 그만두고 11월에 새 직장에 들어간 영업직 송태윤 씨 — 같은 해 근로소득을 받은 곳이 두 곳이라, 새 회사가 두 소득을 합산해 연말정산하지 않으면 다음 해 5월에 합쳐서 종합소득세를 신고해요. (근거: 국세청 종합소득세 개요, 2인 이상으로부터 받는 근로소득)
근로소득만 있는 사람은 연말정산을 했다면 신고하지 않아도 되지만, 연말정산을 하지 아니한 경우 는 신고해야 해요. 같은 해 2인 이상 에게서 근로소득을 받았는데 합산해 정산하지 못했다면 이 경우도 신고해야 해요. 아래 세 질문으로 내가 어디에 해당하는지 가려요. 신고는 홈택스에서 하고, 끝나면 개인지방소득세 신고로 이어서 이동해요.
신고를 놓치면 붙는 가산세는 연말정산 가산세 글에서 이어서 볼 수 있어요. 연말정산 가산세 →
국세청 종합소득세 개요 당해 과세기간에 종합소득금액이 있는 자는 다음해 5월 1일부터 5월 31일(성실신고확인서 제출자는 6월 30일)까지 종합소득세를 신고·납부하여야 합니다(소득세법 §70, §70조의2).
2025년 귀속 신고 기한은 6월 1일까지였고 그 뒤에 내는 신고는 기한후 신고예요. 환급이 나올 신고는 기한후 환급신고 화면에서 내요.
신고납부기한이 공휴일이나 토요일이면 그 다음날까지 신고납부할 수 있어서 2025년 귀속은 6월 1일까지로 안내돼요. 신고하지 않으면 각종 세액공제와 감면을 받을 수 없고, 낼 세금이 있다면 일반 무신고 기준으로 무신고납부세액의 20%인 가산세가 붙어요. 올해 퇴사했다면 신고 기한은 내년 5월 1일부터 5월 31일이에요.
국세청 종합소득세 개요 2025년 귀속 종합소득세 신고는 ’26.6.1.까지(성실신고확인서 제출자는 ’26.6.30.까지) 신고
홈택스 신고를 마치면 개인지방소득세 신고로 이어서 이동해요. 홈택스와 위택스가 연결돼 국세와 지방세를 같이 신고할 수 있어요.
개인지방소득세는 귀속연도와 무관하게 지방자치단체의 장(시·군·구청장)에게 신고해요. 홈택스에서 소득세 신고를 마친 뒤 신고내역조회 화면의 지방소득세 신고이동 버튼을 누르면 위택스 신고서 작성으로 넘어가요.
국세청 종합소득세 개요 홈택스(국세)와 위택스(지방세)를 실시간 연계하는 원클릭 전자신고시스템을 통해 국세와 지방세를 동시에 편리하게 신고할 수 있습니다.
회사 정산에는 공제 신고가, 5월 신고에는 공제 대상 증명서류와 소득 계산 서류가 필요해요. 공제 대상 서류는 홈택스 간소화 자료로 모아요.
| 구분 | 서류 | 누가 내나요 | 어디서 준비하나요 |
|---|---|---|---|
| 회사 정산 | 부양가족 등 공제를 반영하기 위한 공제 신고 내용 | 퇴사하는 근로자 | 퇴사 전 회사 연말정산 담당 부서 |
| 공제 증명 | 인적공제·연금보험료공제·주택담보노후연금 이자비용공제·특별소득공제·자녀세액공제·연금계좌세액공제·특별세액공제 대상임을 증명하는 서류 | 공제를 받으려는 모든 신고자 | 홈택스 간소화 자료 조회 화면간소화 자료 조회하기 부양가족 자료제공 동의하기 |
| 빠진 의료비 | 간소화 자료에 조회되지 않는 의료비 내역 | 해당 지출이 있는 신고자 | 조회되지 않는 의료비 신고센터누락 의료비 신고하기 |
| 소득 계산 | 종합소득금액 계산의 기초가 된 총수입금액과 필요경비의 계산에 필요한 서류 | 근로소득 외 소득이 있는 신고자 | 근로소득과 합쳐 신고하는 화면종합소득세 신고하기 |
| 장부·명세 | 장부로 계산했다면 재무상태표·손익계산서와 그 부속서류, 장부가 없다면 추계소득금액 계산서 | 사업소득이 있는 신고자 | 근로소득과 합쳐 신고하는 화면종합소득세 신고하기 |
5월 신고서에는 인적공제·연금보험료공제·특별소득공제·자녀세액공제·연금계좌세액공제·특별세액공제 대상임을 증명하는 서류를 붙여요. 근로소득만 있다면 공제 대상 증명서류 가 핵심이에요. 근로소득 외 사업소득이 있다면 총수입금액과 필요경비 계산에 필요한 서류가 더해져요. 장부로 계산했다면 재무상태표·손익계산서 같은 서류도 붙여요.
간소화 자료를 조회하는 순서는 연말정산 간소화서비스 이용방법 글에서 이어서 볼 수 있어요. 연말정산 간소화서비스 이용방법 →
소득세법 제70조 제4항 제1호 인적공제, 연금보험료공제, 주택담보노후연금 이자비용공제, 특별소득공제, 자녀세액공제, 연금계좌세액공제 및 특별세액공제 대상임을 증명하는 서류로서 대통령령으로 정하는 것
공제 대상 증명서류를 붙여 5월 신고서로 내요. 회사 정산에서 본인 기본공제와 표준세액공제만 적용됐다면 그 밖의 공제는 이 서류로 따져요.
신고서에 붙이는 첫 번째 서류가 인적공제 등 공제 대상임을 증명하는 서류예요. 퇴사 전에 공제 신고를 내지 못했다면 회사 정산에는 본인분만 반영됐을 수 있으니, 부양가족이나 지출 자료를 이 서류로 챙겨요.
신고서나 서류에 미비한 사항이나 오류가 있으면 관할 세무서장이 보정을 요구할 수 있어요. 요구가 오면 그 내용대로 채워 내요.
보정 요구는 신고를 거부하는 것이 아니라 빠진 부분을 채우라는 요청이에요. 제출한 신고서의 공제 항목마다 증명서류를 짝지어 두면 보정 요구를 줄일 수 있어요.
소득세법 제70조 제5항 납세지 관할 세무서장은 제4항에 따라 제출된 신고서나 그 밖의 서류에 미비한 사항 또는 오류가 있을 때에는 그 보정을 요구할 수 있다.
회사 정산에서 낸 세금이 더 많으면 초과액을 돌려받고, 5월 신고분은 신고한 뒤 홈택스 환급금 조회에서 처리 상태가 보여요.
퇴직 정산에서 이미 낸 세금과 세액공제가 산출세액보다 크면 그 초과액을 근로소득자에게 환급해야 한다고 법이 정해요. 환급 방법은 대통령령으로 정하는 바에 따른다고만 되어 있고, 그 시행령은 이 글이 연 화면에 없어서 날짜는 적지 않았어요. 회사 정산분은 급여 담당 부서에 정산 결과와 환급 방식을 묻고, 5월 신고분은 신고 뒤 홈택스 국세 환급금 상세조회에서 처리 상태를 봐요.
이미 끝낸 정산을 고치고 싶다면 연말정산 경정청구 글에서 이어서 볼 수 있어요. 연말정산 경정청구 →
소득세법 제137조 제2항 제1항제3호에서 해당 과세기간에 제134조제1항에 따라 원천징수한 세액, 외국납부세액공제, 근로소득세액공제, 자녀세액공제, 연금계좌세액공제 및 특별세액공제에 따른 공제세액의 합계액이 종합소득산출세액을 초과하는 경우에는 그 초과액을 그 근로소득자에게 대통령령으로 정하는 바에 따라 환급하여야 한다.
그해 이미 낸 세금과 세액공제 합계가 계산된 산출세액보다 크면 환급이고, 산출세액이 더 크면 추가 납부예요.
비교하는 쪽은 두 가지예요. 한쪽은 퇴직하는 날까지의 근로소득금액에 공제를 적용해 구한 종합소득산출세액이고, 다른 쪽은 그해 원천징수한 세액과 각종 세액공제의 합계예요. 공제 신고를 못 해 본인분만 적용됐다면 5월 신고에서 공제를 더 반영하면서 결과가 달라질 수 있어요.
퇴직하는 달 근로소득을 지급할 때 회사가 해요. 그해 퇴직하는 날까지의 기간을 기준으로 계산해요.
이미 낸 세금과 세액공제가 계산된 세액보다 크면 초과액이 환급돼요. 신고해 보기 전에는 환급인지 추가 납부인지 알 수 없어요.
회사 정산에서는 본인 기본공제와 표준세액공제만 적용돼요. 그 밖의 공제는 5월 종합소득세 신고에서 증명서류를 붙여 따져요.
같은 해 근로소득을 2인 이상에게서 받았는데 합산해 정산하지 못했다면 5월에 합쳐 신고해야 해요. 새 회사가 합산해 연말정산을 했다면 이 경우는 빠져요.
개인지방소득세는 지방자치단체에 따로 신고해요. 홈택스 신고를 마치면 지방소득세 신고이동 버튼으로 위택스에서 이어서 신고해요.
2025년 귀속 신고는 6월 1일까지였고 그 뒤에 내는 신고는 기한후 신고예요. 환급이 나올 신고는 홈택스 기한후 환급신고 화면에서 내요.
떠나기 전 체크
이 글은 법령과 공식 안내를 바탕으로 정리한 참고 자료예요. 개별 사안은 관할 기관이 결정해요. 법령이 바뀌면 표와 위젯의 숫자를 함께 갱신해요.